La supervisión de la política editorial del IEA le corresponde a la Comisión Asesora Científica.

Los directores de las diferentes colecciones y revistas son los siguientes:

• Irene Abad Buil, directora de la colección Iter: Investigación y Territorio.
• Fernando Alvira Banzo, director de la colección Monumenta.
• José Ángel Asensio Esteban, director de la revista Bolskan.
• M.ª Dolores Barrios Martínez, directora de la colección Rememoranzas.
• Francisco Bolea Aguarón, director de la colección Perfil: Guías de Patrimonio Cultural Altoaragonés.
• José Domingo Dueñas Lorente, director de la Colección de Estudios Altoaragoneses / codirector de la colección Larumbe. Textos Aragoneses, junto con Fermín Gil Encabo y Antonio Pérez Lasheras.
• M.ª Celia Fontana Calvo, directora de la revista Argensola.
• Carlos Garcés Manau, director de la colección Cosas Nuestras y de la colección Altoaragoneses.
• José Ángel Sánchez Ibáñez, director de la colección Letras del Año Nuevo.
• Jesús Vázquez Obrador, director de la revista Alazet.
• Director de la revista Lucas Mallada (pendiente de nombramiento).
• Director de la revista Joaquín Costa (pendiente de nombramiento).