Es la encargada de coordinar los trabajos que se llevan a cabo en el desarrollo de las funciones del IEA.

Componentes de la Comisión Asesora Científica:

• Alberto Sabio Alcutén, director científico del IEA
• José Domingo Dueñas Lorente, vicedirector científico del IEA
• Irene Abad Buil, directora del Área de Historia
• Susana Villacampa Sanvicente, directora del Área de Arte
• Julia Justes Floría, directora del Área de Arqueología
• Juan Blas Pérez Lorenz, director del Área de Biomedicina
• José Antonio Cuchí Oterino, director del Área de Ciencias Aplicadas y Tecnología
• M.ª Victoria Sanagustín Fons, directora del Área de Ciencias Económicas y Políticas
• Pilar Catalán Rodríguez, directora del Área de Ciencias de la Naturaleza
• Ángel Gari Lacruz, director del Área de Ciencias Sociales
• Ángel Gonzalvo Vallespí, director del Área de Comunicación Audiovisual
• Helena Giné Abad, directora del Área de Geografía y Ordenación del Territorio
• Ramón Acín Fanlo, director del Área de Lengua y Literatura
• Juan Rovira Marsal, representante de las entidades colaboradoras del IEA