Es la encargada de coordinar los trabajos que se llevan a cabo en el desarrollo de las funciones del IEA.
Componentes de la Comisión Asesora Científica:
- Alberto Sabio Alcutén, director científico del IEA
- José Domingo Dueñas Lorente, vicedirector científico del IEA
- Irene Abad Buil, directora del Área de Historia
- Susana Villacampa Sanvicente, directora del Área de Arte
- Julia Justes Floría, directora del Área de Arqueología
- Juan Blas Pérez Lorenz, director del Área de Biomedicina
- José Antonio Cuchí Oterino, director del Área de Ciencias Aplicadas y Tecnología
- M.ª Victoria Sanagustín Fons, directora del Área de Ciencias Económicas y Políticas
- Pilar Catalán Rodríguez, directora del Área de Ciencias de la Naturaleza
- Ángel Gari Lacruz, director del Área de Ciencias Sociales
- Ángel Gonzalvo Vallespí, director del Área de Comunicación Audiovisual
- Helena Giné Abad, directora del Área de Geografía y Ordenación del Territorio
- Ramón Acín Fanlo, director del Área de Lengua y Literatura
- Juan Rovira Marsal, representante de las entidades colaboradoras del IEA