La supervisión de la política editorial del IEA le corresponde a la Comisión Asesora Científica.
Los directores de las diferentes colecciones y revistas son los siguientes:
- Irene Abad Buil, directora de la colección Iter: Investigación y Territorio
- Fernando Alvira Banzo, director de la colección Monumenta
- Juan Carlos Ara Torralba, director de la revista Joaquín Costa
- José Ángel Asensio Esteban, director de la revista Bolskan
- M.ª Dolores Barrios Martínez, directora de la colección Rememoranzas
- Francisco Bolea Aguarón, director de la colección Perfil: Guías de Patrimonio Cultural Altoaragonés
- José Antonio Cuchí Oterino y Ernesto Pérez-Collazos, codirectores de la revista Lucas Mallada
- José Domingo Dueñas Lorente, director de la Colección de Estudios Altoaragoneses y codirector de la colección Larumbe. Textos Aragoneses
- M.ª Celia Fontana Calvo, directora de la revista Argensola
- Carlos Garcés Manau, director de la colección Cosas Nuestras y de la colección Altoaragoneses
- Fermín Gil Encabo, codirector de la colección Larumbe. Textos Aragoneses
- José Ángel Sánchez Ibáñez, director de la colección Letras del Año Nuevo
- Jesús Vázquez Obrador, director de la revista Alazet