La supervisión de la política editorial del IEA le corresponde a la Comisión Asesora Científica.

Los directores de las diferentes colecciones y revistas son los siguientes:

• Irene Abad Buil, directora de la colección Iter: Investigación y Territorio
• Fernando Alvira Banzo, director de la colección Monumenta
• Juan Carlos Ara Torralba, director de la revista Joaquín Costa
• José Ángel Asensio Esteban, director de la revista Bolskan
• M.ª Dolores Barrios Martínez, directora de la colección Rememoranzas
• Francisco Bolea Aguarón, director de la colección Perfil: Guías de Patrimonio Cultural Altoaragonés
• José Antonio Cuchí Oterino y Ernesto Pérez-Collazos, codirectores de la revista Lucas Mallada
• José Domingo Dueñas Lorente, director de la Colección de Estudios Altoaragoneses y codirector de la colección Larumbe. Textos Aragoneses
• M.ª Celia Fontana Calvo, directora de la revista Argensola
• Carlos Garcés Manau, director de la colección Cosas Nuestras y de la colección Altoaragoneses
• Fermín Gil Encabo, codirector de la colección Larumbe. Textos Aragoneses
• José Ángel Sánchez Ibáñez, director de la colección Letras del Año Nuevo
• Jesús Vázquez Obrador, director de la revista Alazet