Asume el gobierno y la dirección de las actividades culturales y científicas del IEA, garantizando la adecuación de sus tareas a los fines fundacionales.
Con naturaleza de consejo sectorial, el Consejo Rector del IEA está compuesto por los siguientes miembros:
Presidente
- Francisco Mateo Rivas, presidente de la Comisión de Cultura de la Diputación Provincial de Huesca
Vocales
- María Isabel de Pablo Melero, vicepresidenta de la Comisión de Cultura de la Diputación Provincial de Huesca
- Alberto Sabio Alcutén, director científico del IEA
- José Domingo Dueñas Lorente, vicedirector científico del IEA
- Sofía Avellanas Montori, diputada
- Joaquín Monesma Delgado, diputado
- Antonio Comps Encuentra, diputado
- Juan Ignacio Espot Ruiz, diputado
- Francisco Aísa Otín, diputado
- Cristian Royo Blecua, diputado
- Ángel Gari Lacruz, representante de los directores de las Áreas de Trabajo
- Juan Rovira Marsal, representante de las entidades colaboradoras
- Marta Liesa Orús, representante de la Universidad de Zaragoza
- Teodoro Lasanta Martínez, representante del CSIC